İyi bilinen iki tip izoformu mevcuttur.
COX-1 ve
COX-2. Son zamanlarda COX-3 diye isimlendirilen bir üçüncü formu daha bulunmuşsa da henüz işlevi üzerinde çalışmalar devam etmektedir.
COX-1 ve
COX-2 enzimleri önce kararsız yapıda
prostoglandin PGH2 üretimi yaparlar, daha sonra hücreye özgül olarak kararlı
prostoglandinlerin yapımını sağlarlar.