Tıbbi pratikte, Pulmoner Emboli (PE) ile Pulmoner Tromboemboli (PTE) terimleri sıklıkla birbirinin yerine kullanılsa da patolojik olarak aralarında net bir ayrım vardır.

Pulmoner tromboemboli, akciğer damarlarını tıkayan maddenin doğrudan bir kan pıhtısı (trombüs) olduğu özel durumdur.

Pulmoner emboli, akciğer arterlerinin kan pıhtısı dahil herhangi bir yabancı madde veya kitle tarafından tıkanması durumunu ifade eden genel bir terimdir.

Yani her pulmoner tromboemboli bir pulmoner embolidir, ancak her pulmoner emboli bir pulmoner tromboemboli değildir.