İnce ve kalın bağırsakların birleşim yerine yaklaşık olarak 70 cm. uzaklıkta doğumsal bir kalıntıdır.

Gebeliğin çok erken dönemlerinde, bağırsaklar henüz oluşurken, ileride ince bağırsağın gelişeceği ön bağırsak (foregut) olarak tanımlanan kısım ile yine ileride göbeğin oluşacağı bölge arasında kanal şeklinde bir bağlantı vardır (omfalomezenterik kanal). Zamanla bu bağlantı daralır ve kaybolur. Eğer bu kanalın ince bağırsak tarafındaki kısmı dışarı doğru uzanan bir çıkıntı halinde kaybolmayarak kalacak olursa, oluşan durum Meckel divertikülüdür. Meckel divertikülü iç duvarı genellikle bağırsağın iç duvar yapısından farklıdır. Burada en sık olarak saptanan iki doku mide ve pankreastır. Ektopik (yabancı-olmaması gereken yerde bulunan) dokular olarak tanımlanan bu yapılar, başta kanama olmak üzere divertiküle ilişkin sorunların ortaya çıkmasına neden olan yapılardır.