Doku reddindeki vücudun dokuyu reddetmesi mekanizmasının tersine; nakledilen dokudaki B hücreleri ve T hücreleri tarafından vücuttaki yabancı konak hücrelerinin reddedilmesi ile karakterize durum

GVHH kemik iliği naklinin en önemli sorunudur. Verici iliğindeki T hücreleri, alıcı dokuyu yabancı olarak tanıyıp ona karşı reaksiyon verir. Böylece alıcı dokuyu hasarlar. Başlıca üç hedef organda epitel hücre nekrozuna yol açar; karaciğer (sarılık), deri (deri döküntüsü), barsak mukozası (diare).

Çözüm; verici iliğinde T hücrelerinin azaltılmasıdır, böylece GVHH riski azalır. Fakat greft başarısızlığı ve lösemi nüksü riski artar.