FKÜnün etkileri çoktur ve son derece ciddidir. Belki de en önemli sorun, kan ve diğer dokularda fenilalaninin anormal birikmesidir. Bu durum sinir dokusunu o kadar olumsuz etkiler ki, etkilenen bireylerin %90'ının IQ'su 40'ın altındadır. Bu nedenle ciddi zeka geriliği vardır. Tüm FKÜ vakalarının üçte ikisinde mikrosefali (beyin boyutunda azalma) görülür.
ADMiN
FKÜ vakalarının %75'inde kas hipertonisitesinin bacak ve kol kaslarının kasılmasına neden olduğu ve bireylerin kollarını vücutlarına doğru çekerek çapraz bacaklı oturduğu "terzi duruşu" görülür:
Her yeni doğan bebekten küçük bir kan örneği alınır ve bu örnek, bakteriyel büyümeyi inhibe ederek kandaki yüksek fenilalanin düzeylerini tespit eden Guthrie testine tabi tutulur.