ışık yerine elektron ışını görüntü oluşturarak çok daha yüksek büyütme ve çözünürlük sağlayan mikroskop.

Görüntü floresan ekranda izlenebilir veya fotoğraflanabilir. Tarama ve geçirgen elektron mikroskopları bu tür mikroskoplara örnektir.